个人简介

李莉，2018年于北京大学生命科学学院获得博士学位，主要研究人类胚胎生殖细胞的发育过程及其表观遗传调控。2019-2023年在哈佛大学医学院/波士顿儿童医院进行博士后训练，期间开发了单细胞多组学谱系示踪小鼠模型和测序工具，并将其运用于造血干细胞的发育与迁移过程的研究。2024年初加入西湖大学生命科学学院任特聘研究员，博士生导师。

研究方向

无论是器官再生、延缓衰老还是癌症治疗过程中都涉及到基本的细胞命运选择问题。李莉博士开发的DARLIN 小鼠模型和 Camellia-seq 测序技术能够用来研究生理或病理条件下不同组织中细胞的谱系关系及其转录组和表观组的分子特征，为我们系统理解细胞增殖、分化、迁移和凋亡等带来全新视角。实验室一方面将运用已建立的多组学谱系示踪小鼠模型来研究发育过程和炎症与免疫过程中的细胞命运调控机制，另一方面将致力于开发新一代的谱系示踪动物模型和高通量的单细胞表观组谱系示踪技术，为全面理解并调控细胞命运奠定基础。

代表论文

^#co-first author        * co-corresponding author

1. L. Li^#, S. Bowling^#, H. Lin, D. Chen, S.-W. Wang*, F. D. Camargo*, DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity. Nature Protocols., doi: 10.1038/s41596-025-01141-z (2025).

2. M. Chen^#, R. Fu^#, Y. Chen, L. Li*, S.-W. Wang*, High-resolution, noninvasive single-cell lineage tracing in mice and humans based on DNA methylation epimutations. Nature Methods, doi: 10.1038/s41592-024-02567-1 (2025).

3. L. Li, S. Bowling, S. E. McGeary, Q. Yu, B. Lemke, K. Alcedo, Y. Jia, X. Liu, M. Ferreira, A. M. Klein, S.-W. Wang*, F. D. Camargo*, A mouse model with high clonal barcode diversity for joint lineage, transcriptomic, and epigenomic profiling in single cells. Cell 186, 5183-5199.e22 (2023).

Research highlight in Nature Methods: Tang, L. Greater diversity for lineage tracing. Nature Methods 20, 1872 (2023).

4. L. Li^#, L. Li^#, Q. Li^#, X. Liu^#, X. Ma^#, J. Yong, S. Gao, X. Wu, Y. Wei, X. Wang, W. Wang, R. Li, J. Yan, X. Zhu, L. Wen, J. Qiao, L. Yan*, F. Tang*, Dissecting the epigenomic dynamics of human fetal germ cell development at single-cell resolution. Cell Research 31, 463–477 (2021).

5. L. Li^#, J. Dong^#, L. Yan^#, J. Yong, X. Liu, Y. Hu, X. Fan, X. Wu, H. Guo, X. Wang, X. Zhu, R. Li, J. Yan, Y. Wei, Y. Zhao, W. Wang, Y. Ren, P. Yuan, Z. Yan, B. Hu, F. Guo, L. Wen, F. Tang*, J. Qiao*, Single-cell RNA-seq analysis maps development of human germline cells and gonadal niche interactions. Cell Stem Cell 20, 858-873.e4 (2017).

6. R. Wang^#, X. Liu^#, L. Li^#, M. Yang, J. Yong, F. Zhai, L. Wen, L. Yan, J. Qiao*, F. Tang*, Dissecting human gonadal cell lineage specification and sex determination using A single-cell RNA-seq approach. Genomics Proteomics Bioinformatics 20, 223–245 (2022).

7. S. H. Patel, C. Christodoulou, C. Weinreb, Q. Yu, E. L. da Rocha, B. J. Pepe-Mooney, S. Bowling, L. Li, F. Osorio, G. Daley, F. Camargo, Lifelong multilineage contribution by embryonic-born blood progenitors. Nature 606, 747–753 (2022).

8. Q. Ji^#, Y. Zheng^#, G. Zhang, Y. Hu, X. Fan, Y. Hou, L. Wen, L. Li, Y. Xu, Y. Wang*, F. Tang*, Single-cell RNA-seq analysis reveals the progression of human osteoarthritis. Annals of the rheumatic diseases 78, 100–110 (2019).

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电子邮箱：lili@westlake.edu.cn

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