个人简介

程赛凤，湖北孝感人。2007年就读于华中农业大学生命科学与技术基地班，本硕博连读后于2017年获得华中农业大学生物化学与分子生物学博士学位，主要研究转录因子和表观修饰在水稻顶端分生组织发育中的调控作用。2018-2023年在以色列威兹曼科学研究所进行博士后研究，研究方向为小鼠胚胎发育过程中DNA甲基化调控细胞命运决定的作用机制。博士后期间获得EMBO Long-Term Fellowship。将于2024年入职西湖大学生命科学学院，任特聘研究员、博士生导师。

学术成果及研究方向

多细胞生物内具有相同基因组的细胞如何分化成形态、结构和功能不同的细胞类群是生物学领域的一个基本研究问题。一方面，细胞分化由细胞内在的转录水平和表观修饰水平决定；另一方面，这一过程也受到细胞与细胞之间相互作用的影响，并且这两类调控因子均随着时间的推移而变化。因此，当我们研究细胞分化的调控机理，尤其是那些具有广泛效应的作用机制（例如表观遗传调控）时，必须要在不同的发育时期内，将基因的直接效应（自主性效应）与由于其他细胞类型中信号转导累积而来的间接效应（非自主性效应）区分开来。

小鼠胚胎发育是研究细胞命运决定的重要模型。在此过程中，DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质空间结构等表观修饰经历了剧烈的重编程。通过对不同程度的嵌合体胚胎的转录组分析，结合基于时间的细胞分化图谱，程赛凤博士证实，DNA去甲基化对原肠胚时期的大多数细胞分化程序来说是非必需条件，且DNA去甲基化更倾向于在全基因组范围内微调基因的表达，而非传统观点认为的指导性作用。该研究也提供了一套解析胚胎发育时期基因功能的方法，使得我们能够有效区分基因的自主效应与非自主效应。

这一发现也促使我们重新审视各种表观修饰在细胞分化中的作用。为了深入研究这一问题，课题组将以小鼠胚胎发育为研究对象，综合运用单细胞转录组、囊胚注射、基因编辑等技术，结合体内和体外模型，研究：（1）组蛋白修饰在早期细胞命运决定中的作用；（2）顺式作用元件调控细胞分化的机理；（3）表观修饰在胚外谱系发育及胚外谱系与胚胎谱系相互作用中的调控机理。

代表论文

* These authors contributed equally，^# Co-correspondence

1. Yoav Mayshar*, Ofir Raz*, Saifeng Cheng, Raz Ben-Yair, Ron Hadas, Netta Reines, Markus Mittnenzweig, Oren Ben-Kiki, Aviezer Lifshitz, Amos Tanay^#, Yonatan Stelzer^#. (2023). Time-aligned hourglass gastrulation models in rabbit and mouse. Cell 186, 2610-2627.e18. 10.1016/j.cell.2023.04.037.

2. Marko Dunjić*, Felix Jonas*, Gilad Yaakov*, Roye More, Yoav Mayshar, Yoach Rais, Ayelet-Hashahar Orenbuch, Saifeng Cheng, Naama Barkai, Yonatan Stelzer. (2023). Histone exchange sensors reveal variant specific dynamics in mouse embryonic stem cells. Nat Commun 14, 1–19. 10.1038/s41467-023-39477-3.

3. Saifeng Cheng, Yoav Mayshar, Yonatan Stelzer. (2023). Induced epigenetic changes memorized across generations in mice. Cell 186, 683–685. 10.1016/j.cell.2023.01.023.

4. Saifeng Cheng*, Markus Mittnenzweig*, Yoav Mayshar, Aviezer Lifshitz, Marko Dunjić, Yoach Rais, Raz Ben-Yair, Stephanie Gehrs, Elad Chomsky, Zohar Mukamel, Hernan Rubinstein, Katharina Schlereth, Netta Reines, Ayelet-Hashahar Orenbuch, Amos Tanay^#, Yonatan Stelzer^#. (2022). The intrinsic and extrinsic effects of TET proteins during gastrulation. Cell 185, 3169-3185.e20.

5. Markus Mittnenzweig*, Yoav Mayshar*, Saifeng Cheng, Raz Ben-Yair, Ron Hadas, Yoach Rais, Elad Chomsky, Netta Reines, Anna Uzonyi, Lior Lumerman, Aviezer Lifshitz, Zohar Mukamel, Ayelet-Hashahar Orenbuch, Amos Tanay^#, Yonatan Stelzer^#. (2021). A single-embryo, single-cell time-resolved model for mouse gastrulation. Cell 184, 2825-2842.e22. 10.1016/j.cell.2021.04.004.

6. Alejandro Aguilera-Castrejon*, Bernardo Oldak*, Tom Shani, Nadir Ghanem, Chen Itzkovich, Sharon Slomovich, Shadi Tarazi, Jonathan Bayerl, Valeriya Chugaeva, Muneef Ayyash, Shahd Ashouokhi, Daoud Sheban, Nir Livnat, Lior Lasman, Sergey Viukov, Mirie Zerbib, Yoseph Addadi, Yoach Rais, Saifeng Cheng, Yonatan Stelzer, Hadas Keren-Shaul, Raanan Shlomo, Rada Massarwa, Noa Novershtern, Itay Maza^#, Jacob H Hanna^#. (2021). Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis. Nature 593, 119–124. 10.1038/s41586-021-03416-3.

7. Saifeng Cheng, Feng Tan, Yue Lu, Xiaoyun Liu, Tiantian Li, Wenjia Yuan, Yu Zhao, Dao-Xiu Zhou. (2018). WOX11 recruits a histone H3K27me3 demethylase to promote gene expression during shoot development in rice. Nucleic Acids Res 46, 2356–2369. 10.1093/nar/gky017.

8. Shaoli Zhou,Wei Jiang, Fei Long, Saifeng Cheng, Wenjing Yang, Yu Zhao, and Dao-Xiu Zhou. (2017). Rice Homeodomain Protein WOX11 Recruits a Histone Acetyltransferase Complex to Establish Programs of Cell Proliferation of Crown Root Meristem. Plant Cell 29, 1088–1104. 10.1105/tpc.16.00908.

9.  Yu Zhao*, Saifeng Cheng*, Yaling Song, Yulan Huang, Shaoli Zhou, Xiaoyun Liu, Dao-Xiu Zhou. (2015). The Interaction between Rice ERF3 and WOX11 Promotes Crown Root Development by Regulating Gene Expression Involved in Cytokinin Signaling. Plant Cell 27, 2469–2483. 10.1105/tpc.15.00227.

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