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王寿文博士
Shou-Wen Wang, Ph.D.
谱系追踪实验室
王寿文博士
Shou-Wen Wang, Ph.D.
谱系追踪实验室
“让我们一起前往知识的荒原，充满激情、好奇和无畏，开辟一个美丽的新世界！”
个人简介
王寿文，2009-2013年获清华大学工程物理系本科学位，并辅修计算机专业。2013－2018年在清华大学获得物理学博士学位。2018-2022年在哈佛大学医学院系统生物学系进行博士后研究工作。博士后期间获得了Damon Runyon癌症研究基金会的资助。2023年起，任西湖大学生命科学学院特聘研究员、博士生导师，任西湖大学理学院物理系兼聘教授。王寿文博士长期专注于细胞谱系追踪领域，开发了首个基于DNA甲基化突变的非侵入式谱系追踪工具MethylTree，为在人体中的进行单细胞多组学谱系研究提供了全新的方法。
学术成果及研究方向
细胞谱系，即细胞在个体中的分裂历史，对于全面理解个体的发育、衰老以及疾病机制至关重要。谱系追踪的目标是就是重建细胞在体内的分裂历史。在单细胞谱系追踪领域，王博士取得了一系列成果，包括：
1、开发CoSpar，结合细胞谱系与转录组精准预测细胞命运（2022年，Nature Biotechnology，第一作者兼共同通讯作者）
2、共同开发新一代谱系追踪小鼠DARLIN、单细胞多组学技术Camellia-seq，并发现造血干细胞的表观克隆记忆性（2023年，Cell，共同通讯作者）
3、开发基于DNA甲基化突变的非侵入式谱系追踪MethylTree（2025年，Nature Methods，通讯作者）。
目前，实验室主要围绕单细胞DNA甲基化与谱系追踪的研究。一方面，开发高通量、低成本的单细胞DNA甲基化检测技术，提升谱系追踪算法的可靠性，并将其应用于多种人体组织，进行多组学谱系追踪以解答一系列此前无法解答的重大科学问题；另一方面，结合机器学习技术，深度挖掘DNA甲基化数据，在表观遗传层面为个体发育与衰老带来新的见解。
本实验室干湿结合, 注重学科交叉，热忱欢迎来自实验生物学、计算生物学、物理学、计算机科学等不同学科背景的研究者加入我们，共同探索前沿科学问题！详情请见实验室网站https://www.shouwenwang-lab.com/。
代表论文
* These are corresponding authors.
+ These authors contribute equally.
1, L. Li+, S. Bowling+, H. Lin, D. Chen, S.-W. Wang*, F. D. Camargo*, DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity, Nature Protocols (2025).
2, M. Chen+, R. Fu+, Y. Chen, L. Li* & S.-W. Wang*, High-resolution, noninvasive single-cell lineage tracing in mice and humans based on DNA methylation epimutations, Nature Methods (2025).
3, S.-W. Wang*, MethylTree: exploring epimutations for accurate and non-invasive lineage tracing, Nature Methods (2025).
4, L. Li, S. Bowling, S. E. McGeary, Q. Yu, B. Lemke, K. Alcedo, Y. Jia, X. Liu, M. Ferreira, A. M. Klein, S.-W. Wang*, F. D. Camargo*, A mouse model with high clonal barcode diversity for joint lineage, transcriptomic, and epigenomic profiling in single cells, Cell (2023).
5, S.-W. Wang*, M. J. Herriges, K. Hurley, D. N. Kotton, A. M. Klein*, CoSpar identifies early cell fate biases from single cell transcriptomic and lineage information, Nature Biotechnology (2022).
6, A. E. Rodriguez-Fraticelli, C. S. Weinreb, S.-W. Wang, R. P. Migueles, M. Jankovic, M. Usart, A. M. Klein, S. Lowell, F. D. Camargo*, Combined single cell lineage and transcriptome sequencing reveals Tcf15 as a master regulator of hematopoietic stem cell fate, Nature 583, 585 (2020).
7, S.-W. Wang*, and L.-H. Tang*, Emergence of collective oscillations in adaptive cells, Nature Communications 10, 5613 (2019).
8, S.-W. Wang, A.-F. Bitbol*, N. S. Wingreen*, Revealing evolutionary constraints on proteins through sequence analysis, PLOS Computational Biology 15, e1007010 (2019)
9, S.-W. Wang, K. Kawaguchi, S.-i. Sasa and L.-H. Tang, Entropy production of nanosystems with time scale separation, Physical Review Letters 117, 070601 (2016).
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